蚌埠医学院于1958年7月建校,是国家首批具有硕士学位授予权单位、国家首批临床医学硕士专业学位研究生培养模式改革试点高校、教育部硕士研究生推免高校、安徽省院士工作站和博士后岗位设置单位,现为暨南大学、安徽医科大学博士研究生联合培养单位。2023年11月,经教育部批准,学校更名为蚌埠医科大学。
学校于1979年开始招收硕士研究生,并于1981年被国务院学位委员会批准为首批硕士学位授予权单位。现有5个医学类(基础医学、临床医学、公共卫生与预防医学、药学、护理学)、1个理学类(生物学)一级学科硕士学位授予点;6个医学类(临床医学、口腔医学、公共卫生、护理、药学、医学技术)、1个工学类(生物与医药)、2个教育学类(应用心理、体育)硕士专业学位授予类别。临床医学、药理学与毒理学进入ESI全球排名前1%。现有博士生导师近100名,硕士生导师1300余名,在校硕士研究生3200余名(含留学生)。
学校始终坚持立德树人根本任务,注重研究生教育内涵式发展,突出服务经济社会发展、创新精神和实践能力培养。学校重视与国内外高水平单位联合培养,先后与二十余家培养单位建立了研究生联合培养基地,实现资源共享、合作共赢、协同创新,通过跨学科、跨院校、产学研联合培养等多种途径,培养高层次应用型医学人才,研究生培养质量受到社会高度评价。